杭州师范大学档案馆成立于2009年1月，为学校直属机构。其前身是成立于1988年1月的综合档案室。它既是学校档案工作的职能管理部门，又是永久保存和提供利用本校档案信息资源的科学文化事业机构。

馆舍建筑面积4859平方米，其中库房面积3277平方米。馆藏档案丰富，包括杭州师范学院、杭州医学高等专科学校、杭州教育学院、杭州护士学校、杭州卫生学校、杭州农业高等专科学校、杭州师范学校、杭州工艺美术学校、杭州法律学校共十个全宗。截止2021年底，馆藏档案总数8.5万余卷、87万件，包括党群、行政、教学及实物等多种载体多个门类。这些档案反映了杭州师范大学创建、变迁、发展、建设的历程，具有极其重要的史料价值和学术价值。

档案馆1998年荣获浙江省档案工作目标管理“省一级达标单位”，2011年荣获“2010年度浙江省高校档案工作先进单位”，2012年荣获“浙江省规范化数字档案室”称号，2014年荣获“浙江省示范数字档案室”称号。

档案馆2020年建成“精品档案陈列室”，展出李叔同字画、《浙江两级师范学堂同学录》、《浙一师校友会志》、“浙江省立临时联合师范学校”期间的“学籍卡”等珍稀档案300余件。

秉持“对历史负责、为现实服务、替未来着想”的工作理念，档案馆积极推进档案载体数字化、档案接收电子化、档案利用高效化，更好地服务于学校中心工作，服务于广大师生校友。

档案馆查档利用室位于行政楼339室，提供档案查询服务。